参考链接1 TMB的定义 TMB的定义如下:TMB was defined as the number of …
作者: KevinZhou
使用facets进行肿瘤拷贝数推断
github dariober/cnv_facets 官网 安装cnv_facets conda create…
Mutation CCF的计算和通过PyClone推断肿瘤亚克隆
通过vcf文件推断突变CCF(Cancer Cell Fraction) vcf文件中已经有了AF(Allel…
从零开始的BISCUT+推断体系CNA的fitness(适应度)
Github网址 安装 conda create -n biscut conda activate biscu…
使用Annovar进行vcf注释并绘制瀑布图
1. 下载Annovar软件本体 https://annovar.openbioinformatics.org…
dN/dS 的计算,核心理念及应用
核心理念原文链接 dN/dS 是什么 这里的 S 即 Synonymous,N 即 Nonsynonymous…
配置OncoAnalyzer
conda create -n hmftools_env conda activate hmftools_en…
禁用UniAccess Agent
@echo on set /a count=0 set /a max=10 :loop if %count% …
从Cellranger Count开始的velocyto、scvelo速率分析
1. 首先使用 cellranger count 处理原始fastq文件 cellranger count -…
单细胞Seurat>h5>h5ad>loom
Seurat>h5 (R的Dior包) # 首先在~/.bashrc中添加以下配置,防止文件只能读/写 …