使用说明书: https://github.com/xjtu-omics/msisensor-pro/blob…
月度归档: 2025 年 2 月
pyclone-vi 亚克隆鉴定 + Citup进化树推断 + Timescape 可视化
1.使用mutect按病人同时处理样本 gatk Mutect2 -R /data02/zhangmengme…
vcf2maf
perl -ne 'chomp;next if($_=~/^$/);my @a=split /\t/…
manta+strelka2/varscan2 call somatic mutation
manta+strelka2 call somatic mutation bgzip -f AgilentV6…
fasta参考基因组常规预处理
bwa 预处理 bwa index gencode_GRCh38.p14.genome.fa samtools…