官方github:https://github.com/PapenfussLab/gridss/blob/ma…
使用mergeSVvcf合并结构变异vcf文件
官方github:https://github.com/papaemmelab/mergeSVvcf 下载py…
使用AmpliconSuite-pipeline进行ecDNA分析
官方github网址:https://github.com/AmpliconSuite/AmpliconSui…
使用telomerehunter2计算端粒长度
官方github链接:https://github.com/ferdinand-popp/telomerehu…
使用Delly进行结构变异分析
github官网:https://github.com/dellytools/delly hg38.excl …
使用 mosdepth 统计 WES/WGS 测序深度
github链接:https://github.com/brentp/mosdepth 单样本运行 mosde…
从 fasta 创建用于 GATK WGS 流程的 interval list
# 用 fasta 创建 faidx 和 dict 索引 gatk CreateSequenceDiction…
cellranger mkref 构建参考基因文件
官方教程:https://www.10xgenomics.com/support/software/cell-…
ABSOLUTE安装与使用
安装参考: https://geekdaxue.co/read/biotrainee@wes/rrwrli#f…
Ubantu 系统上 Docker 的安装
官网链接:https://docs.docker.com/engine/install/ubuntu/ 1. …